办理出口到洪都拉斯的FTA（自由贸易协定）原产地证，可以按照以下步骤进行：

1. 了解FTA协定和原产地证要求：首先，需要了解中国与洪都拉斯之间的FTA协定内容，特别是关于原产地证的规定和要求。确保出口的商品符合FTA协定的原产地规则。

2. 准备必要文件：准备出口货物的相关文件，包括但不限于出口合同、商业发票、装箱单、提单等。

3. 获取原产地声明书或申请表格：联系当地的原产地证签发机构（通常是当地的海关或贸促会），获取原产地声明书或申请表格。

4. 填写原产地声明书或申请表格：按照要求填写原产地声明书或申请表格，包括出口货物的详细信息、生产过程、原材料来源等。确保填写准确无误。

5. 提交文件和证明材料：将已填写的原产地声明书或申请表格，以及相关文件和证明材料（如生产记录、原材料来源证明等）提交给当地的海关或贸促会。

6. 审核和签发：当地的海关或贸促会对提交的文件和证明材料进行审核，确认货物符合FTA协定的原产地规则。审核通过后，将签发FTA原产地证。

7. 寄送原产地证：将签发的FTA原产地证寄送给进口商或相关机构，以便进口商在洪都拉斯进行清关手续。

注意事项：

1. 确保所出口的商品符合洪都拉斯的标准和要求，包括产品质量、安全、卫生等方面的要求。

2. 在办理过程中，保持与当地海关或贸促会的沟通，确保办理流程的顺利进行。

3. 注意办理时间和费用，合理安排办理时间和预算。

以上步骤仅供参考，具体流程可能因地区和机构而有所不同。建议联系当地的海关或贸促会，获取详细的办理流程和要求。