香港公司出口日本并申请RCEP（区域全面经济伙伴关系协定）产地证的方法如下：

1. 了解RCEP产地证：首先，要了解RCEP的原产地规则和要求，确保所出口的商品符合RCEP的优惠条件。

2. 准备必要文件：需要准备相关的出口文件，如合同、发票、装箱单、提单等。这些文件将用于证明出口商品的原产地和价值。

3. 申请RCEP产地证：

  * 在香港，可以通过向香港的出口商申请RCEP产地证。具体申请流程和所需文件可以向当地贸易机构或咨询公司进行咨询。

  * 在申请时，需要提供详细的商品信息，包括商品名称、型号、数量、价格等，以及证明商品原产地的文件。

4. 提交申请并等待审核：将申请提交给相关部门进行审核。审核过程可能需要一些时间，具体时间取决于当地的规定和申请的复杂性。

5. 获得RCEP产地证：一旦申请被批准，就可以获得RCEP产地证。该证书将证明您的商品符合RCEP的原产地规则和要求，并享受相关的关税优惠。

6. 使用RCEP产地证：获得RCEP产地证后，可以在与日本进行贸易时使用该证书。将证书提供给日本的进口商或相关机构，以享受RCEP提供的关税优惠。

请注意，具体的申请流程和要求可能因地区和具体情况而有所不同。因此，建议在申请前仔细阅读相关的规定和要求，或咨询当地贸易机构或专业咨询公司的意见。